Zwołał kilka synodów, na których potępiono symonię i małżeństwa księży. Nie zdążył wznowić rozmów z Kościołem bizantyjskim, by zakończyć schizmę.
Św. Stefan był on synem księcia Lotaryngii, wnukiem ostatniego króla Italii. Zanim został papieżem, najpierw był kanonikiem w Liege (czyt. lież), następnie archidiakonem w kościele św. Lamberta, bibliotekarzem i kanclerzem papieża Leona IX.
Mówi o. Stanisław Tasiemski, dominikanin.
Św. Stefan IX zmarł 29 marca 1058 roku.